{rfName}
Bi

Indexat a

Llicència i ús

Altmetrics

Anàlisi d'autories institucional

Gil-De-La-Fuente, AlbertoAutor o coautor
Compartir
Publicacions
>
Article

BioTransformer: a comprehensive computational tool for small molecule metabolism prediction and metabolite identification

Publicat a:Journal Of Cheminformatics. 11 (2): 2- - 2019-01-05 11(2), DOI: 10.1186/s13321-018-0324-5

Autors: Djoumbou-Feunang, Yannick; Fiamoncini, Jarlei; Gil-de-la-Fuente, Alberto; Greiner, Russell; Manach, Claudine; Wishart, David S

Afiliacions

CEU San Pablo Univ, Dept Informat Technol, Madrid, Spain - Autor o coautor
Univ Alberta, Alberta Machine Intelligence Inst, Edmonton, AB T6G 2E8, Canada - Autor o coautor
Univ Alberta, Dept Biol Sci, Edmonton, AB T6G 2E9, Canada - Autor o coautor
Univ Alberta, Dept Comp Sci, Edmonton, AB T6G 2E8, Canada - Autor o coautor
Univ Clermont Auvergne, Human Nutr Unit, INRA, F-63000 Clermont Ferrand, France - Autor o coautor
Univ Sao Paulo, Sch Pharmaceut Sci, Dept Food & Expt Nutr, Sao Paulo, Brazil - Autor o coautor
Veure més

Resum

Paraules clau
biotransformationenzyme-substrate specificityknowledge-based systemmachine learningmass spectrometrymetabolic pathwaymetabolism predictionmetabolite identificationmicrobial degradationBiotransformationChlorpyrifosCollectionDatabaseDrug-metabolismEnzyme-substrate specificityEnzymesKnowledgeKnowledge-based systemMachine learningMass spectrometryMetabolic pathwayMetabolism predictionMetabolite identificationMetabolomicsMicrobial degradationPathwaysPerspectivesStructure-based classificationWater

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Journal Of Cheminformatics a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2019, es trobava a la posició 13/156, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Computer Science, Information Systems. Destacable, igualment, el fet que la revista està posicionada per sobre del Percentil 90.

Aquesta publicació ha estat distingida com a “Highly Cited Paper” segons les agències WoS (ESI, Clarivate) i ESI (Clarivate), el que significa que se situa dins del 1% superior dels articles més citats en el seu camp temàtic durant l'any de la seva publicació. En termes de l'impacte observat de l'aportació, aquest treball és considerat com un dels més influents a nivell mundial, en ser considerat com a altament citat. (font consultada: ESI 14 Nov 2024)

I així ho demostren els altíssims impactes normalitzats a través d'alguns dels principals indicadors d'aquest tipus, i que encara que dinàmics en el temps i dependents del conjunt de citacions mitjanes mundials en el moment del seu càlcul, ja apunten a estar molt per sobre de la mitjana en diferents agències:

  • Normalització de cites relatives a la taxa de citació esperada (ESI) de l'agència Clarivate: 8.12 (font consultada: ESI 14 Nov 2024)
  • Mitjana Ponderada de l'Impacte Normalitzat de l'agència Scopus: 13.03 (font consultada: FECYT Febr 2024)
  • Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions: 34.44 (font consultada: Dimensions May 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-05-17, el següent nombre de cites:

  • WoS: 297
  • Scopus: 318
  • Europe PMC: 132
  • OpenCitations: 292
Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-05-17:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 577.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 576 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 52.26.
  • El nombre de mencions a la xarxa social Facebook: 1 (Altmetric).
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 60 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.
Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: Brazil; Canada; France.