Tras licenciarme en Biología por la Universidad de Santiago de Compostela y graduarme como Ingeniero Técnico Informático por la Universidad Nebrija, me incorporé al laboratorio del Dr. Alfonso Valencia en el Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC).

Durante esta etapa diseñé y programé nuevos algoritmos bioinformáticos para crear modelos tridimensionales de la estructura de las proteínas. La estructura 3D de las proteínas está ligada a la función que éstas realizan. Determinar dicha estructura de manera experimental es, a menudo, difícil y, por tanto, predecir computacionalmente modelos estructurales resulta beneficioso para anticipar como las proteínas llevan a cabo su función, y también para el posterior diseño de fármacos que sirvan para combatir enfermedades donde estén involucradas las proteínas. Nuestra aproximación consistió en entrenar una red neuronal artificial como herramienta de predicción de modelos 3D, mediante la incorporación de información evolutiva de las proteínas. Algunos de los modelos tridimensionales que logramos obtener mediante esta aproximación computacional supusieron una mejora notable en el campo, la cual pudimos divulgar mediante publicaciones en revistas científicas internacionales.

Esto nos condujo a participar como evaluadores de una de las categorías de CASP (Critical Assessment of Protein Structure Prediction), una competición internacional que cada dos años evalúa la calidad de los modelos predichos por algoritmos desarrollados en grupos de bioinformática repartidos por todo el globo (la estructura tridimensional de cada proteína usada como target de predicción en la competición ha sido previamente determinada de manera experimental, pero todavía no se ha hecho pública). Evaluar los modelos predichos por cada grupo nos permitió determinar el nivel de mejora en el campo, y publicar los resultados obtenidos en revistas internacionales.

Tras esta etapa inicial, pasé a formar parte de la Unidad de Bioinformática del Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO), dirigida por la Dra. Fátima Al-Shahrour. Dicha unidad tiene como una de sus misiones asistir a los investigadores experimentales del CNIO en el análisis de los datos de carácter masivo que éstos generan, y que están centrados en ampliar el conocimiento básico sobre los mecanismos moleculares del cáncer, y también, en buscar nuevas posibles vías de ataque que conduzcan al desarrollo de nuevos tratamientos trasladables a la clínica. Las técnicas de secuenciación masiva o Next Generation Sequencing (NGS) son muy comunes hoy en día en los laboratorios de Biología Molecular, y exigen de la Bioinformática para el análisis de los datos. En el CNIO, tuve la tarea de coordinar, desde la Unidad de Bioinformática, el análisis de los datos generados por los grupos experimentales.

En paralelo, llevé a cabo mi tesis doctoral con el grupo SING (Sistemas Informáticos de Nueva Generación) de la Universidad de Vigo, cuyo foco fue el desarrollo de herramientas bioinformáticas para analizar datos de NGS, y la cual defendí en Septiembre de 2020. En concreto, desarrollé tres pipelines bioinformáticos para el análisis de datos masivos: uno inicial para determinar niveles de expresión de genes por NGS (RNA-seq), a continuación otro para el análisis de los niveles de metilación del genoma mediante la secuenciación masiva de ADN previamente bisulfitado (BS-seq) y, finalmente, un tercero para la caracterización y cuantificación de poblaciones de bacterias en muestras biológicas mediante el análisis por secuenciación masiva del marcardor ARN ribosomal 16S. Estos tres pipelines dieron lugar a tres publicaciones científicas directas que revirtieron en mi tesis doctoral. Asimismo, dichos pipelines han mostrado tener impacto en su campo, viniendo éste reflejado por el número de publicaciones científicas donde, a día de hoy, han sido referenciados (más de 50 citas según Web of Science). Los trabajos de investigación en los que he tenido la oportunidad de participar, primero desde el CNB y posteriormente desde el CNIO, me han llevado a publicar (ya sea como primer autor o bien como coautor) 85 publicaciones científicas hasta la fecha, que acumulan un total de 4.300 citas  (H-Index 36, Web of Science).

Como actividad adicional, he participado como profesor en el Máster Universitario en Bioinformática y Biología Computacional de la Universidad Autónoma de Madrid, y en el Máster en Bioinformática aplicada a Medicina Personalizada y Salud del Instituto de Salud Carlos III, donde he impartido diferentes aspectos de NGS y Bioinformática.

Recientemente me he incorporado a la Universidad CEU San Pablo como profesor a tiempo completo.