{rfName}
CE

Indexat a

Llicència i ús

Citacions

304

Altmetrics

Anàlisi d'autories institucional

Gil-De-La-Fuente AAutor (correspondència)Godzien JAutor o coautorSaugar SAutor o coautorGarcia-Carmona RAutor o coautorBarbas C.Autor o coautorOtero A.Autor o coautor

Compartir

4 defebrer de 2019
Publicacions
>
Article
No

CEU Mass Mediator 3

Publicat a:Journal Of Proteome Research. 18 (2): 797-802 - 2019-02-01 18(2), DOI: 10.1021/acs.jproteome.8b00720

Autors: Gil-de-la-Fuente, Alberto; Godzien, Joanna; Saugar, Sergio; Garcia-Carmona, Rodrigo; Badran, Hasan; Wishart, David S; Barbas, Coral; Otero, Abraham

Afiliacions

Centre for Metabolomics and Bioanalysis (CEMBIO), Facultad de Farmacia , Universidad San Pablo-CEU, CEU Universities, Campus Montepríncipe , Boadilla del Monte, Madrid 28668 , Spain - Autor o coautor
CEU Univ, Univ San Pablo CEU, Escuela Politecn Super, Dept Informat Technol, Campus Monteprincipe, Madrid 28668, Spain - Autor o coautor
CEU Univ, Univ San Pablo CEU, Fac Farm, Ctr Metabol & Bioanal CEMBIO, Campus Monteprincipe, Madrid 28668, Spain - Autor o coautor
Department of Biological Sciences University of Alberta , Edmonton , Alberta T6G 2E9 , Canada - Autor o coautor
Department of Computing Science , University of Alberta , Edmonton , Alberta T6G 2E8 , Canada - Autor o coautor
Department of Information Technology, Escuela Politécnica Superior , Universidad San Pablo-CEU, CEU Universities, Campus Montepríncipe , Boadilla del Monte, Madrid 28668 , Spain - Autor o coautor
Faculty of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences , University of Alberta , Edmonton , Alberta T6G 2N8 , Canada - Autor o coautor
Univ Alberta, Dept Biol Sci, Edmonton, AB T6G 2E9, Canada - Autor o coautor
Univ Alberta, Dept Comp Sci, Edmonton, AB T6G 2E8, Canada - Autor o coautor
Univ Alberta, Fac Pharm & Pharmaceut Sci, Edmonton, AB T6G 2N8, Canada - Autor o coautor
Universidad CEU San Pablo. ESCUELA POLITECNICA SUPERI. Tecnologias de la Información - Autor o coautor
Veure més

Resum

CEU Mass Mediator (CMM, http://ceumass.eps.uspceu.es ) is an online tool that has evolved from a simple interface to query different metabolomic databases (CMM 1.0) to a tool that unifies the compounds from these databases and, using an expert system with knowledge about the experimental setup and the compounds properties, filters and scores the query results (CMM 2.0). Since this last major revision, CMM has continued to grow, expanding the knowledge base of its expert system and including new services to support researchers in the metabolite annotation and identification process. The information from external databases has been refreshed, and an in-house library with oxidized lipids not present in other sources has been added. This has increased the number of experimental metabolites up 332,665 and the number of predicted metabolites to 681,198. Furthermore, new taxonomy and ontology metadata have been included. CMM has expanded its functionalities with a service for the annotation of oxidized glycerophosphocholines, a service for spectral comparison from MS2 data, and a spectral quality-assessment service to determine the reliability of a spectrum for compound identification purposes. To facilitate the collaboration and integration of CMM with external tools and metabolomic platforms, a RESTful API has been created, and it has already been integrated into the HMDB (Human Metabolome Database). This paper will present the novel functionalities incorporated into version 3.0 of CMM.

Paraules clau

AnimalsAnnotationData curationDatabasesDatabases, factualHumansIdentificationInformation disseminationKnowledge representationLipid metabolismMass spectrometryMetabolomicsPhosphorylcholineRestSoftwareSoftware toolWeb services

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Journal Of Proteome Research a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2019, es trobava a la posició 12/77, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Biochemical Research Methods.

Des d'una perspectiva relativa, i tenint en compte l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir de les Citacions Mundials proporcionades per WoS (ESI, Clarivate), proporciona un valor per a la normalització de citacions relatives a la taxa de citació esperada de: 5.3. Això indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: ESI 14 Nov 2024)

Aquesta informació es reforça amb altres indicadors del mateix tipus, que encara que dinàmics en el temps i dependents del conjunt de citacions mitjanes mundials en el moment del seu càlcul, coincideixen a posicionar en algun moment el treball, entre el 50% més citats dins de la seva temàtica:

  • Mitjana Ponderada de l'Impacte Normalitzat de l'agència Scopus: 4.16 (font consultada: FECYT Febr 2024)
  • Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions: 12.65 (font consultada: Dimensions Aug 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-08-02, el següent nombre de cites:

  • WoS: 110
  • Scopus: 116
  • Europe PMC: 72

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-08-02:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 189.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 199 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 28.5.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 28 (Altmetric).

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: Canada.

Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Primer Autor (Gil de la Fuente, Alberto) i Últim Autor (OTERO QUINTANA, ABRAHAN).

l'autor responsable d'establir les tasques de correspondència ha estat Gil de la Fuente, Alberto.