{rfName}
De

Indexat a

Llicència i ús

Icono OpenAccess

Altmetrics

Anàlisi d'autories institucional

Sáez-álvarez YAutor o coautorDel Aguila C.Autor o coautorAgudo RAutor (correspondència)

Compartir

23 d’abril de 2019
Publicacions
>
Article

Development of a fluorescence-based method for the rapid determination of Zika virus polymerase activity and the screening of antiviral drugs

Publicat a: Scientific Reports. 9 (5397): 5397- - 2019-12-01 9(5397), DOI: 10.1038/s41598-019-41998-1

Autors: Saez-Alvarez, Yanira; Arias, Armando; del Aguila, Carmen; Agudo, Ruben

Afiliacions

Tech Univ Denmark, Life Sci & Bioengn Bldg, DK-2800 Lyngby, Denmark - Autor o coautor
Univ San Pablo CEU, CEU Univ, Fac Farm, Madrid 28668, Spain - Autor o coautor

Resum

Zika virus (ZIKV) is an emerging pathogen that has been associated with large numbers of cases of severe neurologic disease, including Guillain-Barre syndrome and microcephaly. Despite its recent establishment as a serious global public health concern there are no licensed therapeutics to control this virus. Accordingly, there is an urgent need to develop methods for the high-throughput screening of antiviral agents. We describe here a fluorescence-based method to monitor the real-time polymerization activity of Zika virus RNA-dependent RNA polymerase (RdRp). By using homopolymeric RNA template molecules, de novo RNA synthesis can be detected with a fluorescent dye, which permits the specific quantification and kinetics of double-strand RNA formation. ZIKV RdRp activity detected using this fluorescence-based assay positively correlated with traditional assays measuring the incorporation of radiolabeled nucleotides. We also validated this method as a suitable assay for the identification of ZIKV inhibitors targeting the viral polymerase using known broad-spectrum inhibitors. The assay was also successfully adapted to detect RNA polymerization activity by different RdRps, illustrated here using purified RdRps from hepatitis C virus and foot-and-mouth disease virus. The potential of fluorescence-based approaches for the enzymatic characterization of viral polymerases, as well as for high-throughput screening of antiviral drugs, are discussed.

Paraules clau

AnimalsAntiviral agentsBiologyCell-cultureChain-reactionDependent rna-polymeraseDrug discoveryError catastropheFluorescenceGuillain-barre syndromeHepatitis-c virusHigh-throughput screening assaysHumansIdentificationMicrocephalyNs5 proteinNucleoside inhibitorsRibavirinRna-dependent rna polymeraseVirus replicationZika virusZika virus infection

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Scientific Reports a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2019, es trobava a la posició 17/71, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Multidisciplinary Sciences.

Des d'una perspectiva relativa, i tenint en compte l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir de les Citacions Mundials proporcionades per WoS (ESI, Clarivate), proporciona un valor per a la normalització de citacions relatives a la taxa de citació esperada de: 1.42. Això indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: ESI 13 Nov 2025)

Aquesta informació es reforça amb altres indicadors del mateix tipus, que encara que dinàmics en el temps i dependents del conjunt de citacions mitjanes mundials en el moment del seu càlcul, coincideixen a posicionar en algun moment el treball, entre el 50% més citats dins de la seva temàtica:

  • Mitjana Ponderada de l'Impacte Normalitzat de l'agència Scopus: 1.17 (font consultada: FECYT Mar 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-12-05, el següent nombre de cites:

  • WoS: 35
  • Scopus: 39
  • Europe PMC: 35

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-12-05:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 115.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 114 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 11.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 3 (Altmetric).
  • El nombre de mencions a mitjans de comunicació: 1 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: Denmark.

Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Primer Autor (Sáez Álvarez, Yanira) i Últim Autor (Agudo Torres, Ruben).

l'autor responsable d'establir les tasques de correspondència ha estat Agudo Torres, Ruben.

Reconeixements vinculats a l’ítem

We would like to thank to laboratory of Professor Esteban Domingo (Centro de Biologia Molecular Severo Ochoa, Madrid) for providing plasmids pET-28a3Dpol, pET-28aD338A, Jc1FLAG2(p7-nsGluc2a) and Jc1FLAG2(p7-nsGluc2a)/GNN, and Professor Luis Blanco (Centro de Biologia Molecular Severo Ochoa, Madrid) for allowing the use of his laboratory to perform the polymerization experiments in the presence of radiolabeled nucleotides. This work was supported by grants RYC-2015-17280 and BIO2017-85124-R from Ministerio de Economia, Industria y Competitividad. Y S-A. is the recipient of an FPI-predoctoral fellowship from Universidad CEU San Pablo. AA is the recipient of a Research project-1 grant from Independent Research Fund Denmark (Technology and Production Sciences, DFF-FTP), application number 6111-00104B.