{rfName}
De

Indexado en

Licencia y uso

Icono OpenAccess

Altmetrics

Investigadores/as Institucionales

Sáez-álvarez YAutor o CoautorDel Aguila C.Autor o CoautorAgudo RAutor (correspondencia)

Compartir

23 de abril de 2019
Publicaciones
>
Artículo

Development of a fluorescence-based method for the rapid determination of Zika virus polymerase activity and the screening of antiviral drugs

Publicado en: Scientific Reports. 9 (5397): 5397- - 2019-12-01 9(5397), DOI: 10.1038/s41598-019-41998-1

Autores: Saez-Alvarez, Yanira; Arias, Armando; del Aguila, Carmen; Agudo, Ruben

Afiliaciones

Tech Univ Denmark, Life Sci & Bioengn Bldg, DK-2800 Lyngby, Denmark - Autor o Coautor
Univ San Pablo CEU, CEU Univ, Fac Farm, Madrid 28668, Spain - Autor o Coautor

Resumen

Zika virus (ZIKV) is an emerging pathogen that has been associated with large numbers of cases of severe neurologic disease, including Guillain-Barre syndrome and microcephaly. Despite its recent establishment as a serious global public health concern there are no licensed therapeutics to control this virus. Accordingly, there is an urgent need to develop methods for the high-throughput screening of antiviral agents. We describe here a fluorescence-based method to monitor the real-time polymerization activity of Zika virus RNA-dependent RNA polymerase (RdRp). By using homopolymeric RNA template molecules, de novo RNA synthesis can be detected with a fluorescent dye, which permits the specific quantification and kinetics of double-strand RNA formation. ZIKV RdRp activity detected using this fluorescence-based assay positively correlated with traditional assays measuring the incorporation of radiolabeled nucleotides. We also validated this method as a suitable assay for the identification of ZIKV inhibitors targeting the viral polymerase using known broad-spectrum inhibitors. The assay was also successfully adapted to detect RNA polymerization activity by different RdRps, illustrated here using purified RdRps from hepatitis C virus and foot-and-mouth disease virus. The potential of fluorescence-based approaches for the enzymatic characterization of viral polymerases, as well as for high-throughput screening of antiviral drugs, are discussed.

Palabras clave

AnimalsAntiviral agentsBiologyCell-cultureChain-reactionDependent rna-polymeraseDrug discoveryError catastropheFluorescenceGuillain-barre syndromeHepatitis-c virusHigh-throughput screening assaysHumansIdentificationMicrocephalyNs5 proteinNucleoside inhibitorsRibavirinRna-dependent rna polymeraseVirus replicationZika virusZika virus infection

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Scientific Reports debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2019, se encontraba en la posición 17/71, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Multidisciplinary Sciences.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir de las Citas Mundiales proporcionadas por WoS (ESI, Clarivate), arroja un valor para la normalización de citas relativas a la tasa de citación esperada de: 1.42. Esto indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: ESI 13 Nov 2025)

Esta información viene reforzada por otros indicadores del mismo tipo, que aunque dinámicos en el tiempo y dependientes del conjunto de citaciones medias mundiales en el momento de su cálculo, coinciden en posicionar en algún momento al trabajo, entre el 50% más citados dentro de su temática:

  • Media Ponderada del Impacto Normalizado de la agencia Scopus: 1.17 (fuente consultada: FECYT Mar 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-12-05, el siguiente número de citas:

  • WoS: 35
  • Scopus: 39
  • Europe PMC: 35

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-12-05:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 115.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 114 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 11.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 3 (Altmetric).
  • El número de menciones en medios de comunicación: 1 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.

Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Denmark.

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (Sáez Álvarez, Yanira) y Último Autor (Agudo Torres, Ruben).

el autor responsable de establecer las labores de correspondencia ha sido Agudo Torres, Ruben.

Reconocimientos ligados al ítem

We would like to thank to laboratory of Professor Esteban Domingo (Centro de Biologia Molecular Severo Ochoa, Madrid) for providing plasmids pET-28a3Dpol, pET-28aD338A, Jc1FLAG2(p7-nsGluc2a) and Jc1FLAG2(p7-nsGluc2a)/GNN, and Professor Luis Blanco (Centro de Biologia Molecular Severo Ochoa, Madrid) for allowing the use of his laboratory to perform the polymerization experiments in the presence of radiolabeled nucleotides. This work was supported by grants RYC-2015-17280 and BIO2017-85124-R from Ministerio de Economia, Industria y Competitividad. Y S-A. is the recipient of an FPI-predoctoral fellowship from Universidad CEU San Pablo. AA is the recipient of a Research project-1 grant from Independent Research Fund Denmark (Technology and Production Sciences, DFF-FTP), application number 6111-00104B.