{rfName}
TE

Indexat a

Llicència i ús

Icono OpenAccess

Citacions

106

Altmetrics

Grant support

Ministerio de Economia y Competitividad SAF2013-45111-R Isabel Lopez de SilanesConsejeria de Educacion, Juventud y Deporte, Comunidad de Madrid S2017/BMD-3770 Juan J Montero Maria A BlascoWorld Cancer Research Fund 16-1177 Maria A BlascoFundacion Botin Maria A BlascoMinisterio de Economia y Competitividad SAF2015-72455-EXP Maria A BlascoThe funders had no role in study design, data collection and interpretation, or the decision to submit the work for publication.

Anàlisi d'autories institucional

Grana-Castre, OsvaldoAutor o coautor

Compartir

10 demaig de 2023
Publicacions
>
Article
Sí

TERRA, regulate the transcriptional landscape of pluripotent cells through TRF1-dependent recruitment of PRC2

Publicat a:Elife. 8 e44656- - 2019-08-20 8(), DOI: 10.7554/eLife.44656

Autors: Maria Marion, Rosa; Montero, Juan J; Lopez de Silanes, Isabel; Grana-Castre, Osvaldo; Martinez, Paula; Schoeftner, Stefan; Alejandro Palacios-Fabrega, Jose; Blasco, Maria A

Afiliacions

Astellas Pharma Europe Ltd, Chertsey, England - Autor o coautor
LNCIB, Gen Stabil Unit, Trieste, Italy - Autor o coautor
Spanish Natl Canc Ctr CNIO, Bioinformat Unit, Struct Biol Program, Madrid, Spain - Autor o coautor
Spanish Natl Canc Ctr CNIO, Mol Oncol Program, Telomeres & Telomerase Grp, Madrid, Spain - Autor o coautor
Univ Trieste, Dept Life Sci, Trieste, Italy - Autor o coautor
Veure més

Resum

The mechanisms that regulate pluripotency are still largely unknown. Here, we show that Telomere Repeat Binding Factor 1 (TRF1), a component of the shelterin complex, regulates the genome-wide binding of polycomb and polycomb H3K27me3 repressive marks to pluripotency genes, thereby exerting vast epigenetic changes that contribute to the maintenance of mouse ES cells in a naive state. We further show that TRF1 mediates these effects by regulating TERRA, the lncRNAs transcribed from telomeres. We find that TERRAs are enriched at polycomb and stem cell genes in pluripotent cells and that TRF1 abrogation results in increased TERRA levels and in higher TERRA binding to those genes, coincidental with the induction of cell-fate programs and the loss of the naive state. These results are consistent with a model in which TRF1-dependent changes in TERRA levels modulate polycomb recruitment to pluripotency and differentiation genes. These unprecedented findings explain why TRF1 is essential for the induction and maintenance of pluripotency.

Paraules clau

AnimalsCell differentiationCells, culturedChromosomesDevelopmental regulatorsEpigenesis, geneticEpigenetic regulationGeneGene expressionInduced pluripotent stem cellsLncrnaMammalian telomeresMiceMousePluripotencyPolycombPolycomb complexesPolycomb repressive complex 2ProteinsRegenerative medicineRnaRna, long noncodingSet enrichment analysisStem cellsTelomereTelomere-lengthTelomeric repeat binding protein 1TerraTranscription, geneticTrf1Web server

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Elife a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2019, es trobava a la posició 5/93, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Biology. Destacable, igualment, el fet que la revista està posicionada per sobre del Percentil 90.

Des d'una perspectiva relativa, i tenint en compte l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir de les Citacions Mundials proporcionades per WoS (ESI, Clarivate), proporciona un valor per a la normalització de citacions relatives a la taxa de citació esperada de: 1.84. Això indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: ESI 14 Nov 2024)

Aquesta informació es reforça amb altres indicadors del mateix tipus, que encara que dinàmics en el temps i dependents del conjunt de citacions mitjanes mundials en el moment del seu càlcul, coincideixen a posicionar en algun moment el treball, entre el 50% més citats dins de la seva temàtica:

  • Mitjana Ponderada de l'Impacte Normalitzat de l'agència Scopus: 1.27 (font consultada: FECYT Febr 2024)
  • Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions: 5.28 (font consultada: Dimensions Jul 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-07-16, el següent nombre de cites:

  • WoS: 37
  • Scopus: 39
  • Europe PMC: 30

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-07-16:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 72.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 73 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 68.25.
  • El nombre de mencions a la xarxa social Facebook: 1 (Altmetric).
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 5 (Altmetric).
  • El nombre de mencions a mitjans de comunicació: 8 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: Italy; United Kingdom.