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LDRB is a doctoral student from Programa de Doctorado en Ciencias Biomedicas, Universidad Nacional Autonoma de Mexico and received fellowship #229328 from Consejo Nacional de Ciencia y Tecnologia (http://www.conacyt.gob.mx). Laboratory funding was provided by Consejo Nacional de Ciencia y Tecnologia grant #177962, Programa de Apoyo a Proyectos de Investigacion e Innovacion Tecnologica de la Universidad Nacional Autonoma de Mexico (http://dgapa.unam.mx/html/papiit/papit.html), grant #IN203110, and laboratory budget to JRRE. MD is a grant recipient form the Spanish National Grants (BFU2009-09074, SAF2012-35181 and MEC-CONSOLIDER CSD2007-00023), Generalitat Valenciana Grant (PROMETEO II/2013/001) and Fundacion Botin. IGP is a grant recipient from the IFP, Spain. The funders had no role in study design, data collection and analysis, decision to publish, or preparation of the manuscript.

Análisis de autorías institucional

Gutierrez-Perez, IreneAutor o Coautor

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2 de junio de 2021
Publicaciones
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Artículo
Sí

acal is a Long Non-coding RNA in JNK Signaling in Epithelial Shape Changes during Drosophila Dorsal Closure

Publicado en:Plos Genetics. 11 (2): e1004927- - 2015-02-01 11(2), DOI: 10.1371/journal.pgen.1004927

Autores: Daniel Rios-Barrera, Luis; Gutierrez-Perez, Irene; Dominguez, Maria; Riesgo-Escovar, Rafael

Afiliaciones

Univ Miguel Hernandez, CSIC, Inst Neurociencias, Alicante, Spain - Autor o Coautor
Univ Nacl Autonoma Mexico, Inst Neurobiol, Queretaro, Mexico - Autor o Coautor

Resumen

Dorsal closure is an epithelial remodeling process taking place during Drosophila embryogenesis. JNK signaling coordinates dorsal closure. We identify and characterize acal as a novel negative dorsal closure regulator. acal represents a new level of JNK regulation. The acal locus codes for a conserved, long, non-coding, nuclear RNA. Long non-coding RNAs are an abundant and diverse class of gene regulators. Mutations in acal are lethal. acal mRNA expression is dynamic and is processed into a collection of 50 to 120 bp fragments. We show that acal lies downstream of raw, a pioneer protein, helping explain part of raw functions, and interacts genetically with Polycomb. acal functions in trans regulating mRNA expression of two genes involved in JNK signaling and dorsal closure: Connector of kinase to AP1 (Cka) and anterior open (aop). Cka is a conserved scaffold protein that brings together JNK and Jun, and aop is a transcription factor. Misregulation of Cka and aop can account for dorsal closure phenotypes in acal mutants.

Palabras clave

Acal long non-coding rna, drosophilaAdaptor proteins, signal transducingAnimalsAop protein, drosophilaBody patterningCell morphogenesisCka protein, drosophilaDistinct rolesDrosophila melanogasterDrosophila proteinsEncodesEpithelial cellsEye proteinsFinger proteinGene expression regulation, developmentalGenomeIdentificationMap kinase signaling systemMelanogasterMessenger-rnaMutationN-terminal kinasePathwayPhenotypePolycomb-group proteinsRepressor proteinsRna, long noncodingSignal transduction

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Plos Genetics debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2015, se encontraba en la posición 15/166, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Genetics & Heredity.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir del Field Citation Ratio (FCR) de la fuente Dimensions, arroja un valor de: 3.04, lo que indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: Dimensions Aug 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-08-21, el siguiente número de citas:

  • WoS: 31
  • Europe PMC: 20

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-08-21:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 40.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 40 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 4.
  • El número de menciones en la red social Facebook: 1 (Altmetric).
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 8 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.

Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Mexico.